Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm28047Q3US59 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm28047Q3US59 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm28047Q3US59 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm28047Q3US59 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gm28047Q3US59 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Gm28047Q3US59 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Gm28047Q3US59 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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Gm28047Q3US59 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Gm28047Q3US59 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28047Q3US59 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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