Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nhlrc4Q3UP44 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nhlrc4Q3UP44 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms