Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms