Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ulk3Q3U3Q1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms