Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hace1Q3U0D9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hace1Q3U0D9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms