Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Ccndbp1Q3TVC7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Ccndbp1Q3TVC7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccndbp1Q3TVC7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccndbp1Q3TVC7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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