Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc7a1Q09143 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms