Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms