Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdr16c6Q05A13 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms