Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VcpQ01853 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VcpQ01853 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VcpQ01853 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VcpQ01853 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VcpQ01853 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VcpQ01853 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VcpQ01853 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms