Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms