Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cux2P70298 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cux2P70298 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cux2P70298 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cux2P70298 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cux2P70298 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cux2P70298 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cux2P70298 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms