Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd13P70217 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd13P70217 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd13P70217 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd13P70217 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd13P70217 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd13P70217 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd13P70217 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd13P70217 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms