Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta2P62737 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta2P62737 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta2P62737 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta2P62737 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta2P62737 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta2P62737 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta2P62737 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Acta2P62737 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Acta2P62737 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms