Protein–RNA interactions for Protein: P61092

Siah1a, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1A, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1aP61092 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah1aP61092 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms