Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms