Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps5P59438 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps5P59438 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps5P59438 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps5P59438 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps5P59438 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps5P59438 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps5P59438 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps5P59438 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms