Protein–RNA interactions for Protein: P58321

Uchl4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl4P58321 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uchl4P58321 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms