Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Abcd3P55096 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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