Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnfP51944 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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CcnfP51944 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnfP51944 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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CcnfP51944 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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CcnfP51944 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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CcnfP51944 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnfP51944 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnfP51944 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnfP51944 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnfP51944 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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