Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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