Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpdP50404 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpdP50404 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpdP50404 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpdP50404 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms