Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrprbP47758 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrprbP47758 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrprbP47758 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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SrprbP47758 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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SrprbP47758 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrprbP47758 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrprbP47758 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrprbP47758 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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SrprbP47758 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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