Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VhlP40338 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
VhlP40338 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VhlP40338 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VhlP40338 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VhlP40338 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VhlP40338 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VhlP40338 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VhlP40338 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VhlP40338 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
VhlP40338 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VhlP40338 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VhlP40338 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VhlP40338 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VhlP40338 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VhlP40338 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VhlP40338 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VhlP40338 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VhlP40338 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
VhlP40338 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VhlP40338 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VhlP40338 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VhlP40338 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VhlP40338 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VhlP40338 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VhlP40338 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VhlP40338 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VhlP40338 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VhlP40338 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VhlP40338 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VhlP40338 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VhlP40338 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VhlP40338 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VhlP40338 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VhlP40338 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VhlP40338 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VhlP40338 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
VhlP40338 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VhlP40338 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
VhlP40338 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VhlP40338 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VhlP40338 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VhlP40338 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VhlP40338 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VhlP40338 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VhlP40338 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VhlP40338 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VhlP40338 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
VhlP40338 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VhlP40338 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VhlP40338 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VhlP40338 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VhlP40338 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VhlP40338 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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VhlP40338 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VhlP40338 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VhlP40338 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VhlP40338 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VhlP40338 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VhlP40338 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VhlP40338 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VhlP40338 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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VhlP40338 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VhlP40338 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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VhlP40338 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VhlP40338 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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VhlP40338 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VhlP40338 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VhlP40338 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
VhlP40338 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VhlP40338 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
VhlP40338 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VhlP40338 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VhlP40338 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VhlP40338 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VhlP40338 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VhlP40338 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VhlP40338 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VhlP40338 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VhlP40338 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VhlP40338 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VhlP40338 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VhlP40338 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VhlP40338 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VhlP40338 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
VhlP40338 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
VhlP40338 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VhlP40338 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VhlP40338 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VhlP40338 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VhlP40338 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VhlP40338 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VhlP40338 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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