Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf2P39429 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf2P39429 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf2P39429 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf2P39429 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf2P39429 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf2P39429 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf2P39429 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf2P39429 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Traf2P39429 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Traf2P39429 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Traf2P39429 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf2P39429 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Traf2P39429 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Traf2P39429 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf2P39429 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Traf2P39429 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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