Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrgP28705 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrgP28705 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrgP28705 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrgP28705 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrgP28705 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrgP28705 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrgP28705 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxrgP28705 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RxrgP28705 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrgP28705 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrgP28705 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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