Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd10P28359 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Hoxd10P28359 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd10P28359 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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