Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms