Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZfaP23607 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZfaP23607 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZfaP23607 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZfaP23607 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZfaP23607 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZfaP23607 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZfaP23607 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZfaP23607 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZfaP23607 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZfaP23607 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZfaP23607 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZfaP23607 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZfaP23607 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZfaP23607 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZfaP23607 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZfaP23607 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZfaP23607 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZfaP23607 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZfaP23607 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZfaP23607 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZfaP23607 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZfaP23607 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZfaP23607 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZfaP23607 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZfaP23607 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZfaP23607 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZfaP23607 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZfaP23607 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZfaP23607 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZfaP23607 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZfaP23607 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZfaP23607 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZfaP23607 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZfaP23607 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZfaP23607 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZfaP23607 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZfaP23607 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZfaP23607 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZfaP23607 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZfaP23607 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZfaP23607 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZfaP23607 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZfaP23607 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZfaP23607 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZfaP23607 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZfaP23607 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZfaP23607 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZfaP23607 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZfaP23607 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZfaP23607 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZfaP23607 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZfaP23607 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZfaP23607 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZfaP23607 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZfaP23607 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZfaP23607 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZfaP23607 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZfaP23607 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZfaP23607 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZfaP23607 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZfaP23607 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZfaP23607 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZfaP23607 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZfaP23607 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZfaP23607 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZfaP23607 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZfaP23607 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZfaP23607 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZfaP23607 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZfaP23607 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZfaP23607 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZfaP23607 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZfaP23607 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZfaP23607 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZfaP23607 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms