Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif3aP23116 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms