Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou3f1P21952 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms