Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TP20293 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TP20293 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TP20293 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TP20293 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TP20293 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TP20293 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TP20293 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TP20293 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TP20293 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TP20293 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TP20293 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TP20293 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TP20293 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TP20293 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TP20293 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TP20293 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TP20293 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TP20293 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TP20293 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TP20293 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TP20293 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TP20293 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TP20293 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TP20293 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TP20293 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TP20293 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TP20293 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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TP20293 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TP20293 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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