Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou4f1P17208 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms