Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms