Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtcP11725 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtcP11725 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtcP11725 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtcP11725 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtcP11725 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtcP11725 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtcP11725 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtcP11725 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtcP11725 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtcP11725 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtcP11725 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtcP11725 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
OtcP11725 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtcP11725 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtcP11725 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtcP11725 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtcP11725 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtcP11725 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtcP11725 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtcP11725 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtcP11725 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtcP11725 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtcP11725 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtcP11725 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtcP11725 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtcP11725 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtcP11725 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtcP11725 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtcP11725 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtcP11725 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
OtcP11725 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
OtcP11725 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtcP11725 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
OtcP11725 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
OtcP11725 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtcP11725 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtcP11725 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtcP11725 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtcP11725 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtcP11725 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtcP11725 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtcP11725 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtcP11725 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtcP11725 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtcP11725 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtcP11725 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtcP11725 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtcP11725 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtcP11725 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
OtcP11725 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtcP11725 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtcP11725 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtcP11725 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtcP11725 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtcP11725 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtcP11725 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtcP11725 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtcP11725 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtcP11725 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
OtcP11725 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms