Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P10404 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
P10404 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P10404 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P10404 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P10404 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P10404 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P10404 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P10404 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P10404 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P10404 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P10404 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
P10404 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P10404 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P10404 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P10404 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P10404 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P10404 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P10404 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P10404 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
P10404 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P10404 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P10404 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P10404 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P10404 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P10404 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P10404 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P10404 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P10404 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P10404 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P10404 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P10404 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P10404 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P10404 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P10404 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P10404 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
P10404 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
P10404 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P10404 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
P10404 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P10404 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P10404 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
P10404 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P10404 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P10404 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P10404 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P10404 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
P10404 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P10404 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P10404 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P10404 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
P10404 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
P10404 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
P10404 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P10404 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P10404 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
P10404 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
P10404 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
P10404 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P10404 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
P10404 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
P10404 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
P10404 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
P10404 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P10404 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P10404 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
P10404 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P10404 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
P10404 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
P10404 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P10404 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P10404 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
P10404 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
P10404 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
P10404 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
P10404 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
P10404 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
P10404 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
P10404 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
P10404 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
P10404 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
P10404 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P10404 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P10404 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P10404 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P10404 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P10404 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
P10404 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P10404 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P10404 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P10404 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P10404 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P10404 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P10404 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P10404 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P10404 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P10404 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P10404 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P10404 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P10404 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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