Protein–RNA interactions for Protein: O55055

Trdmt1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdmt1O55055 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdmt1O55055 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms