Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdkO55028 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdkO55028 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdkO55028 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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