Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlkO54988 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SlkO54988 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SlkO54988 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SlkO54988 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SlkO54988 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SlkO54988 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SlkO54988 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SlkO54988 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SlkO54988 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SlkO54988 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SlkO54988 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SlkO54988 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SlkO54988 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SlkO54988 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SlkO54988 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SlkO54988 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SlkO54988 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SlkO54988 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SlkO54988 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SlkO54988 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SlkO54988 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SlkO54988 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SlkO54988 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SlkO54988 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SlkO54988 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SlkO54988 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SlkO54988 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SlkO54988 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SlkO54988 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SlkO54988 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SlkO54988 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SlkO54988 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SlkO54988 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SlkO54988 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SlkO54988 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SlkO54988 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SlkO54988 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SlkO54988 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SlkO54988 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SlkO54988 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SlkO54988 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SlkO54988 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SlkO54988 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SlkO54988 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlkO54988 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlkO54988 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlkO54988 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlkO54988 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlkO54988 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlkO54988 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlkO54988 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlkO54988 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlkO54988 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlkO54988 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlkO54988 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlkO54988 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlkO54988 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlkO54988 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SlkO54988 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlkO54988 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlkO54988 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlkO54988 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlkO54988 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SlkO54988 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlkO54988 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlkO54988 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlkO54988 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlkO54988 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlkO54988 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlkO54988 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SlkO54988 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlkO54988 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlkO54988 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SlkO54988 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlkO54988 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlkO54988 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SlkO54988 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SlkO54988 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SlkO54988 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SlkO54988 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SlkO54988 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SlkO54988 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SlkO54988 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SlkO54988 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SlkO54988 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SlkO54988 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SlkO54988 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SlkO54988 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SlkO54988 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SlkO54988 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SlkO54988 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SlkO54988 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms