Protein–RNA interactions for Protein: O54910

Nfkbie, NF-kappa-B inhibitor epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbieO54910 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbieO54910 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms