Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

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Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Bnc1O35914 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Bnc1O35914 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Bnc1O35914 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Bnc1O35914 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Bnc1O35914 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Bnc1O35914 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Bnc1O35914 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Bnc1O35914 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Bnc1O35914 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Bnc1O35914 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Bnc1O35914 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Bnc1O35914 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Bnc1O35914 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Bnc1O35914 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Bnc1O35914 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Bnc1O35914 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Bnc1O35914 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bnc1O35914 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bnc1O35914 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bnc1O35914 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bnc1O35914 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bnc1O35914 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bnc1O35914 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Bnc1O35914 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bnc1O35914 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bnc1O35914 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bnc1O35914 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bnc1O35914 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bnc1O35914 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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