Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited2O35740 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited2O35740 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cited2O35740 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited2O35740 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited2O35740 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited2O35740 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited2O35740 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited2O35740 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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