Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf18O35714 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf18O35714 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf18O35714 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf18O35714 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf18O35714 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf18O35714 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf18O35714 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf18O35714 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf18O35714 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf18O35714 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf18O35714 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf18O35714 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf18O35714 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf18O35714 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf18O35714 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf18O35714 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf18O35714 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf18O35714 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf18O35714 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf18O35714 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf18O35714 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tnfrsf18O35714 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf18O35714 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms