Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rnf5O35445 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rnf5O35445 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rnf5O35445 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rnf5O35445 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rnf5O35445 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rnf5O35445 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rnf5O35445 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rnf5O35445 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf5O35445 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms