Protein–RNA interactions for Protein: O35089

Cnih2, Protein cornichon homolog 2, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih2O35089 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnih2O35089 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms