Protein–RNA interactions for Protein: J3QK59

Gm6176, Predicted gene 6176, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6176J3QK59 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
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Gm6176J3QK59 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Gm6176J3QK59 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Gm6176J3QK59 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Gm6176J3QK59 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Gm6176J3QK59 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gm6176J3QK59 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gm6176J3QK59 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gm6176J3QK59 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gm6176J3QK59 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gm6176J3QK59 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gm6176J3QK59 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gm6176J3QK59 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Gm6176J3QK59 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6176J3QK59 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms