Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G2

Usp17ld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein D, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17ldG5E8G2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17ldG5E8G2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms