Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Olfr914-202ENSMUST00000217057 4948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Fnbp1-201ENSMUST00000073879 8469 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Prdm16-204ENSMUST00000105636 8426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Prdm16-202ENSMUST00000070313 8429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Smarcc2-202ENSMUST00000099131 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Gm43288-201ENSMUST00000197594 2628 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Gm37608-201ENSMUST00000195696 1880 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Cd8a-201ENSMUST00000066747 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Ank1-215ENSMUST00000173248 7100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Cemip-201ENSMUST00000064174 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Gm19445-201ENSMUST00000193649 2438 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms