Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Gm8247F6VRJ8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Gm8247F6VRJ8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Gm8247F6VRJ8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Gm8247F6VRJ8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Gm8247F6VRJ8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Gm8247F6VRJ8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gm8247F6VRJ8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gm8247F6VRJ8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gm8247F6VRJ8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gm8247F6VRJ8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8247F6VRJ8 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm8247F6VRJ8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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