Protein–RNA interactions for Protein: E9Q649

Gcnt4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt4E9Q649 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Gcnt4E9Q649 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcnt4E9Q649 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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Gcnt4E9Q649 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcnt4E9Q649 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Gcnt4E9Q649 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcnt4E9Q649 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Gcnt4E9Q649 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Gcnt4E9Q649 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Gcnt4E9Q649 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcnt4E9Q649 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcnt4E9Q649 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcnt4E9Q649 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Gcnt4E9Q649 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcnt4E9Q649 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcnt4E9Q649 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcnt4E9Q649 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Gcnt4E9Q649 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Gcnt4E9Q649 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcnt4E9Q649 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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Gcnt4E9Q649 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcnt4E9Q649 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcnt4E9Q649 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcnt4E9Q649 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcnt4E9Q649 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcnt4E9Q649 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcnt4E9Q649 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Gcnt4E9Q649 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcnt4E9Q649 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcnt4E9Q649 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcnt4E9Q649 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcnt4E9Q649 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcnt4E9Q649 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms